冠状动脉疾病

文献之声整合GWAS和eQTL数据的孟


摘要

全基因组关联研究(GWAS)确定了数千种与复杂性状相关的变异,但它们的生物学解释通常仍不清楚。这些变体中的大多数与表达QTL(eQTL)重叠,表明它们可能参与基因表达的调节。基于此种情况提出了一种先进的基于汇总统计的孟德尔随机化方法,它同时使用多个SNP作为仪器和多种基因表达特征作为暴露。当应用于43种人类表型时,它揭示了2,个推定基因,其血液表达与至少一种表型因果关联,导致5,种基因-性状关联;值得注意的是,在之前的GWAS分析中,55%的人在附近没有全基因组显着的SNP。使用独立关联汇总统计(UKBiobank),由于电力问题,大多数这些位点被传统GWAS遗漏。这些新颖的联系中值得注意的是高度和智力相关的PEX19和CDC42,分别已知携带突变导致身材矮小和Takenouchi-Kosaki综合征。这个方法同样揭示了暗示机械连接的新颖的多效因果效应,例如:TSPAN14在类风湿性关节炎,克罗恩病和炎症性肠病中的共同遗传效应。最后,可以证明因果基因可以是高度组织特异性的。先进的孟德尔随机化通过检测关联的更高功率来解锁已发表的GWAS的隐藏价值。它更好地解释了多效性,揭示了复杂和临床特征背后的新生物机制。

基本信息

Title:MendelianRandomizationintegratingGWASandeQTLdatarevealsgeneticdeterminantsof







































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